春の行事 3～5月

水天宮を代表する祭事が、5月3日から7日にかけて行われる春大祭です。
3日の「献茶祭」では、水天宮の神職と梅林寺の僧侶が奉仕する神仏習合の祭典が行われます。表千家不白流のお点前による抹茶を神前に献供し、平和安泰を祈念します。境内では表千家不白流による野点も行われます。
4日の「御神幸祭」は、安徳天皇をはじめ平家一門の霊を弔う祭典です。鮒や赤飯、甘酒などの神饌を神前に供え、祭典後には鮒を筑後川へ放流して川を清めます。
例大祭当日の5日は、早朝から「潮井行事」が行われます。筑後川から潮井を汲んで御神前に供えた後、町内を回りながら各家に潮井をかけ、家内安全を祈願します。潮井を汲むのは、そろいの法被を身につけた瀬下町の青年たちです。
11時からは一年で最も重要な祭祀である「例大祭」、18時からは「夕御饌祭」が斎行され、地元の小学生による「浦安の舞」が奉奏されます。また、春大祭では筑後川と深く結びついた御座船による巡幸も行われ、御座船の前でも浦安の舞が披露されます。
6日の「次日祭」を経て、7日の「納祭」で一連の春大祭を締めくくります。
このほか4月中旬には、水天宮を創祀した千代女（按察使局伊勢）の墓前で「千代松明神墓前祭」が行われます。

夏の行事 6～8月

6月30日に行われるのが「夏越大祓」です。本殿前に設けられた茅の輪をくぐり、半年間に知らず知らずのうちに犯した罪や身についた穢れを祓い、残り半年の無病息災を祈ります。
7月21日は「眞木神社例祭」です。水天宮第22代宮司で勤王の志士として活動した眞木和泉守保臣をはじめ、1864（元治元）年の蛤御門の変に敗れ、天王山で自刃した17烈士、明治維新に殉じた門下生らの御霊を慰めます。
夏の水天宮を代表する行事のひとつが「船太鼓行事」です。壇ノ浦の戦いで安徳天皇が入水した際、源平の兵士たちが船べりを叩き、軍鼓を打って冥福を祈ったという故事に由来すると伝えられています。寛文年間から続く行事で、現在は地域の子どもたちによって受け継がれています。
8月5・6・7日には「夏大祭」が行われます。5日は朝から地域の子どもたちが船太鼓を奉奏し、その後は船太鼓山車を引いて大石町・瀬下町・京町の3町内を練り歩きます。夕方には祭典が斎行され、6日は「献茶祭」と「次日祭」、7日の「納祭」で夏大祭を締めくくります。
8月5日には、水天宮と深い関係を持つ「筑後川花火大会」も開催されます。その起源は1650（慶安3）年、久留米藩2代藩主・有馬忠頼によって現在地の社地と社殿が寄進され、その落成を祝って行われた水天宮奉納花火にあります。370年以上の歴史を持ち、水天宮と筑後川との結びつきを今に伝える久留米の夏の風物詩です。

秋の行事 9～11月

10月25日の「軍艦千歳慰霊祭」では、1944（昭和19）年10月25日のレイテ沖海戦で沈没した軍艦千歳とともに亡くなった人々の御霊を慰めます。千歳は筑後川の別名「千歳川」から艦名が付けられ、艦内には水天宮が奉斎されていました。境内には1978（昭和53）年に建立された軍艦千歳慰霊碑があります。
11月15日は「七五三祭」です。子どもの守護神として信仰される水天宮で、これまでの成長を神様に感謝するとともに、これからも健やかに成長するよう祈願します。

冬の行事 12～2月

12月23日の「新穀感謝祭」では、その年に収穫された新穀を神前に供え、神の恵みに感謝します。
大晦日の12月31日には「年越大祓」が行われ、一年間に身についた罪や穢れを祓います。午前0時の初太鼓とともに新年を迎えると、一年で最初の祭事となる「歳旦祭」が斎行されます。
1月5日は、新年最初の水天宮の縁日に行われる「初水天宮祭」です。
正月最初の辰の日には、水天宮ならではの「辰の水神事」が行われます。当日午前3時、神職が筑後川から水を汲んで清め、その水を携えて「たつの水」と声をかけながら瀬下町内を回り、家々に水を振りかけます。
2月の立春には「神水祈祷」が行われます。神職は立春前から参篭潔斎し、筑後川からいただいた水を祈祷します。この御神水は墨をする際にも用いられ、「いつもじ」と呼ばれる水天宮御守などの奉製につながる、水天宮の水の信仰を象徴する神事です。
2月11日は神武天皇の即位と建国を奉祝する「紀元節祭」。2月14日には、眞木和泉守保臣の子・眞木菊四郎を慰霊する「菊四郎祭」が行われます。菊四郎は父とともに禁門の変に参加し、天王山まで退却しました。父の死後も活動を続けましたが、下関で命を落としています。命日の2月14日には、山口県下関市の赤間神宮裏にある紅石山で墓前祭が行われます。