東五社

舞殿の東側には、5つの末社が一つの社殿に並ぶ「東五社」が鎮座しています。
向かって左から、大楠社・天神社・聖神社・第三社・幸神社です。
御祭神については不詳とする資料もあり、はっきりしていない神社が多くあります。天神社と第三社については三嶋神の御子神を祀るとも伝えられています。
このうち大楠社は、江戸時代初期の境内古絵図にも社殿が描かれている古い末社です。現在は4月15日と11月15日に例祭が行われ、特に秋は三嶋大社の酉祭の前日に斎行されることから、御本社と関わりの深い末社とされています。

西五社

舞殿の西側には、東五社と向かい合うように「西五社」が鎮座しています。
向かって左から、船寄社・飯神社・酒神社・第二社・小楠社の5社です。
こちらも御祭神については資料によって異なる伝承があります。飯神社・酒神社・第二社については三嶋神の御子神を祀るとも伝えられています。
東西それぞれ5社がまとまって並ぶ特徴的な末社なので、舞殿を参拝した際には東西両側にも注目してみてください。

祓戸神社

境内の西側、桜川の清流が流れ込む池の中の島に鎮座しているのが「祓所神社（はらえどじんじゃ）」です。通称「浦島さん」とも呼ばれています。
御祭神は祓戸四神で、三嶋大社の公式資料では瀬織津姫神・速秋津姫神・気吹戸主神・速佐須良姫神とされています。一方、祓所神社例祭では瀬織津比咩・速開都比咩・気吹戸主・速佐須良比咩と表記されています。
祓所神社は、国司の庁がこの島に祓所大神を奉斎したことに始まると伝えられています。国司が三嶋大社へ参拝する際には、まずこの場所で卜部に祓いを行わせ、身を清めてから大社へ参拝したとされています。その由緒からも、三嶋大社における「祓い」と深く関係する神社であることが分かります。
現在の社殿は昭和11年（1936）7月8日に改築されたもので、本殿は春日造、拝殿は入母屋造です。
現在も6月30日の夏越大祓と12月31日の師走大祓にあわせて祓所神社例祭が行われています。

伊豆魂神社

伊豆魂神社（いずたまじんじゃ）は、伊豆一円の戦没英霊を祀る神社です。
三嶋大社公式によると、現在は2375柱が祀られています。
毎年11月4日には伊豆魂奉賛会の主催による伊豆魂神社例祭が行われ、遺族を招いて戦没者の慰霊が行われています。
古くからの摂末社が多い三嶋大社の境内にあって、近代以降の伊豆の歴史を伝える神社です。