洲崎神社の境内には、本殿のほかに三つの重要な境内社が祀られています。長宮（ながのみや）、金毘羅宮（こんぴらぐう）、稲荷神社（いなりじんじゃ）です。いずれも本社と深い信仰的・歴史的関わりを持ち、洲崎神社の信仰体系を補完する存在として、古くから崇敬を集めています。

長宮

洲崎神社の境内社「長宮（ながのみや）」は、拝殿右奥の石段を上がった高所に鎮座しており、海と山、そして人々の暮らしを総合的に守護する四柱の神々をお祀りしています。
祭神は、海の神である豊玉彦命（とよたまひこのみこと）、山の神である大山津見命（おおやまつみのみこと）、厄除や開発の神として信仰される建速須佐之男命（たけはやすさのおのみこと）、そして農工商や医薬・縁結びの神として知られる大物主命（おおものぬしのみこと）です。これら四柱を合祀することで、房総の海・山・里のすべてを守る信仰体系を象徴する社とされています。

金毘羅宮

金毘羅宮は海上交通と航海の守護神・大物主命（おおものぬしのみこと）をお祀りしています。四国の金刀比羅宮の分霊を勧請したとされ、江戸期には海運業や商人の間で「洲崎のこんぴら様」として親しまれました。特に江戸湾を往来する廻船業者や漁師たちから厚い信仰を集め、海難除けや大漁祈願の神として崇敬されています。金毘羅宮の社殿は本殿の南側に位置し、石段を登った先の静かな林間に鎮座しています。

稲荷神社

洲崎神社の境内にある稲荷神社は、五穀豊穣の神・宇迦之御魂神（うかのみたまのかみ）をお祀りしています。安永元年（1772年）に伏見稲荷大社の分霊を勧請して創建されたと伝わり、五穀豊穣・商売繁盛・家内安全の守護神として広く信仰されています。洲崎神社の旧社地一帯は、安房国の豊かな海と山の恵みを象徴する地であり、稲荷神社はその地の産業と生活を支える信仰の対象として発展しました。
社殿の前には朱塗りの鳥居が連なり、その右手には勧請の由来を刻んだ石碑が建てられています。特に近世以降は、農漁業者だけでなく商家や旅人からも「洲崎のお稲荷様」と呼ばれて親しまれ、地域の繁栄と無事を祈る信仰の中心として今も篤い崇敬を集めています。
これら三社はいずれも洲崎神社の神域を守護する「守護三社」として位置づけられ、本殿への参拝とともに回ることで、海・陸・家のすべての安寧を祈る「三社詣（さんじゃまいり）」が行われています。現在も地元では、初詣や祭礼の際に三社を巡る風習が残り、洲崎神社の信仰文化を今に伝えています。