日本三大龍穴の一つと伝わる神聖な場所

貴船神社の龍穴は、奥宮本殿の真下にあると伝えられる神聖な場所です。奈良県の室生龍穴、岡山県の備前龍穴とともに、日本三大龍穴の一つとして知られています。
風水や気学では、龍穴は「大地の気（エネルギー）が湧き出る場所」とされ、古くから特別な場所として大切にされてきました。そのため貴船神社の奥宮は、全国でも有数のパワースポットとして紹介されることが多く、多くの参拝者が訪れています。
龍穴は極めて神聖な場所とされ、その位置は奥宮本殿の地下にあると伝えられています。現在も盛土によって覆われており、直接見ることはできません。本殿の造替や修理が行われる際にも、その存在を守るため細心の注意が払われています。
2011年（平成23年）には、奥宮本殿を元の位置へ戻す附曳神事（ふびきしんじ）が執り行われました。この際も神職でさえ龍穴を直接見ることはなかったと伝えられています。
また、約150年前の附曳神事では、大工が誤って龍穴へノミを落としてしまったところ、竜巻のような突風が吹き、ノミが屋根まで吹き上げられたという伝説が残されています。さらに、その大工は後に命を落としたとも伝えられ、龍穴の神聖さを物語る逸話として語り継がれています。
古く「気生根（きふね）」とも記された貴船は、生命力や気が生まれる場所とも伝えられています。龍穴もその象徴とされ、運気隆昌や心願成就、厄除けなどのご利益があると信じられています。
目にすることはできない場所でありながら、古くからの信仰と数々の伝承によって、貴船神社を代表する神秘的な見どころの一つとなっています。