豊臣秀吉ゆかりの国指定名勝

奥書院と庭園を拝観するには、境内の西側にある参集殿から入ります。常時拝観できるわけではないため、事前の確認が必要です。例祭などの祭事が行われている際は、拝観が中止となることがありますのでご注意ください。
奥書院は江戸時代、多賀大社の別当であった不動院のものであったと伝えられています。桁行14.05メートル、梁間8.96メートル、一重寄棟造、南面および西面に庇が付いた桟瓦葺の建物です。室内には唐獅子などが描かれた金の襖絵があり、安土桃山時代の狩野派を思わせる豪壮な趣が感じられます。
1967年（昭和42年）に滋賀県指定文化財に指定されました。
庭園は奥書院の北側に位置し、書院から庭を見降ろすようになっています。1588年（天正16年）に豊臣秀吉が母・大政所の病気平癒を祈願し、その願いが叶った御礼として奉納した米1万石をもとに築造されました。1935年（昭和10年）に国の名勝に指定された池泉鑑賞式の庭園で、奥には不動三尊石が組まれ、鶴亀の出島が配置されています。また、枯滝の下には石橋が架けられているのを確認できます。石組には室町時代作庭の風格が残り、桜、紅葉、山茶花、樫などが主木として植えられた落ち着いた雰囲気の庭園です。なお、東庭は、日本庭園研究者の森蘊（もりおさむ）によって、1968年（昭和43年）に作庭されました。