外拝殿の奥には内拝殿と本殿が鎮座しています。伏見稲荷大社は第一鳥居、第二鳥居、楼門、外拝殿、内拝殿、本殿が一直線に配置されており、表参道を進むにつれて神域の中心へ導かれる美しい社殿構成となっています。

内拝殿

内拝殿（ないはいでん）は1961年（昭和36年）に創建された比較的新しい建物です。本殿の手前に建ち、参拝者は内拝殿の正面から御祭神へ祈りを捧げます。祭典では神職や関係者が神事を執り行う重要な場所でもあり、本殿と一体となって稲荷信仰を支えています。
建築様式は切妻造、銅板葺で、正面には弓なりに反った美しい唐破風の向拝があります。
大瓶束の両側には鳳凰と花鳥の彫刻が施され、蟇股には尾の先に宝珠を付けた白狐が彫られるなど、細部まで精巧な意匠を見ることができます。

本殿

本殿の創建年代は明らかではありませんが、鎌倉時代にはすでに存在していたと伝えられています。応仁の乱で焼失した後、1494年（明応3年）に再建され、1499年（明応8年）に大造営が行われました。その後も1589年（天正17年）の豊臣秀吉による造営や、1694年（元禄7年）の徳川綱吉の時代の修築など、歴代の武将や幕府の保護を受けながら現在まで受け継がれています。1961年（昭和36年）には稲荷社御鎮座1250年を記念して内拝殿が建立されました。
本殿は五間社流造を基本とし、屋根は檜皮葺で千木・鰹木を置かない形式です。最大の特徴は「稲荷造（いなりづくり）」と呼ばれる独特の建築様式で、前方へ大きく張り出した屋根が側面から見ると「へ」の字のような美しい曲線を描きます。鮮やかな朱色に彩られた社殿と、軒下を飾る絢爛豪華な彫刻は見応えがあり、伏見稲荷大社を代表する建築美の一つとなっています。本殿は国の重要文化財に指定されています。

御祭神・ご利益

伏見稲荷大社の御祭神は、宇迦之御魂大神（うかのみたまのおおかみ）、佐田彦大神（さたひこのおおかみ）、大宮能売大神（おおみやのめのおおかみ）、田中大神（たなかのおおかみ）、四大神（しのおおかみ）の五柱です。この五柱を総称して「稲荷大神」と呼び、全国約3万社ある稲荷神社の信仰の中心となっています。
稲荷大神はもともと五穀豊穣を司る農業神として信仰されてきましたが、稲荷信仰が全国へ広がるにつれて商売繁盛の神として広く知られるようになりました。現在では商売繁盛をはじめ、五穀豊穣、家内安全、事業繁栄、芸能上達、交通安全など幅広いご利益があるとされ、個人の参拝者はもちろん、多くの企業や商店からも厚い信仰を集めています。

本殿裏から参拝

伏見稲荷大社では通常、内拝殿から本殿へ向かって参拝しますが、本殿の裏側へ回って参拝する人も少なくありません。
本殿裏は社殿をより近くから拝礼できる場所で、古くから「本殿裏で参拝すると願いが届きやすい」とも伝えられています。現在も伏見稲荷大社ではこの参拝に配慮し、裏側にも賽銭箱が設けられています。

本殿裏の山遥拝所

本殿の裏側には稲荷山遥拝所があります。稲荷山そのものが御神体であるため、山へ登らなくてもここから稲荷山を遥拝することができます。鳥居をかたどった絵馬が数多く奉納され、表参道とは異なる静かな雰囲気の中でゆっくりと参拝できる場所として親しまれています。