震災前の拝殿

阿蘇神社の神殿前にあるのが拝殿です。阿蘇神社の神殿前にあるのが拝殿です。1948年（昭和23年）に完成しました。現在では入手できない台湾檜を使った社殿は国の指定重要文化財ではありませんが、大変貴重な社殿でした。

震災直後の拝殿

拝殿は楼門と共に阿蘇神社で一番被害を受けた社殿で全壊してしまいました。
阿蘇神社の拝殿は楼門や神殿と異なり、国の指定重要文化財ではありません。そのため公的補助の対象外で寄付金を募り再建を目指しました。拝殿再建の工事費約７億２５００万円のうち半分以上（約5億円）を寄付金でまかないました。阿蘇神社の復旧への想いが伝わります。

復旧した拝殿

復旧された拝殿は指定文化財ではないため、楼門と違い新しく県内産の檜を使って建立されました。耐震補強のため、基礎には鉄筋の地中梁を使うなど地震対策もされています。また震災で損壊を免れた両端の神饌所と神輿庫はそのまま活かされています
また、廃材とはいえ、貴重な台湾檜をこのまま捨てるのは忍びないとことで、廃材を使った御朱印帳が限定3000冊で作られました。