御社殿

現在の御社殿は、1961（昭和36）年に再建されたものです。前の御社殿は、1945（昭和20）年の東京大空襲で焼失してしまいました。1998（平成10）年には平成の大改修が行われ、2011（平成23）年には屋根が改修されています。
御社殿はコンクリート造りになっており、拝殿は切妻屋根のシンプルな造りであり、本殿は切妻屋根で千木と鰹木がある神明造になっています。横からみると拝殿と幣殿と本殿が繋がっているようにみえるので、権現造りの流れです。

御祭神・ご利益

主祭神は天照大御神（あまてらすおおみかみ）です。また天児屋根命（あめのこやねのみこと）と応神天皇（おおじんてんのう）を配祀しています。
財運隆昌・良縁のほか、蛇は脱皮することから、病気平癒・心身清浄の御利益をいただけます。また白蛇さまとともに龍神様がお祀りされていることから、巳が龍（身が立つ）＝立身出世の御利益もいただけます。
蛇窪神社の御祈願、「白蛇祈願（予約制）」では、財運隆昌・立身出世・商売繁昌・良縁成就・病気平癒をはじめ、除災招福・心願成就・厄除・八方除（方位除）・家内安全・子授け・安産・合格・学業成就・必勝・芸能上達・交通安全・結婚奉告祭など、さまざまな祈願が可能です。白蛇祈願を行った方には、御神札・お守り白蛇・記念品が授与されます。
また、巳の日に重ねて祈願をする「巳かさね祈願」も行われています。個人祈祷は10回からとなっていますが、参列は初回のみで可。次回の巳の日からは、早朝に神職が祝詞を奏上し、祈願を重ねます。「巳かさね祈願」の申し込みをされた方には、御祈願の御札・記念品が授与され、満願となった際には巳かさね満願御幣が郵送されます。

源平枝垂れ桃

御社殿の右手に立つ枝垂れ桃は、春になると赤・白・まだら、3色の花を咲かせます。突然変異で生まれた白蛇さまにちなみ、植樹されました。