宇佐神宮日本で最も多い八幡系神社の総本宮であり、宇佐八幡として古来より日本の国家祭祀や神仏習合などに重要な役割を果たした神社です。
八重垣神社素盞嗚尊と稲田姫命の夫婦神を祀ることから良縁や夫婦円満の信仰を集め、奥の院「佐久佐女の森」にある鏡の池で行う、紙を水に浮かべて縁を占う「縁占い」が特に有名です。
大神神社三輪山をご神体とするため本殿を持たない古代祭祀の名残がある古社で三輪明神とも呼ばれます。
霧島神宮記紀神話で有名な天孫降臨(てんそんこうりん)の伝説に深く関わる神社として知られています。